Евангелион 3.0: Ты

После выхода из коматозного состояния юноша осознаёт, что мир вокруг изменился до неузнаваемости. Сдерживающий ошейник на его шее служит напоминанием о том, как всё стало иным. Мисато и Аска вместе с остальными теперь выступают против NERV, сражаясь на стороне WILLE. Прошло уже 14 лет после разрушительного Третьего удара, но из-за проклятия «Евы» пилоты остались подростками. Несмотря на уверения Мисато, что Рэй больше нет, она неожиданно появляется на новейшем роботе серии «Марк» и спасает Синдзи из воздушного линкора, принадлежащего WILLE.